Образовательная деятельность

  1. Курс лабораторных работ «Специальный физический практикум - современные методы исследования биологических систем» для студентов 5 курса кафедры «Биофизика» (2012-2013 год)

  2. Методические пособия:

  3. Учебная дисциплина «Одномолекулярные методы в биологических исследованиях» для аспирантов Лаборатории молекулярной микробиологии

    Эта дисциплина позволит аспирантам познакомиться с теоретическими основами новейших методов изучения биологических процессов на уровне одиночных молекул, а также получить практические навыки использования этих методов для решения конкретных научных задач. В рамках курса аспиранты знакомятся с методами оптического захвата, а также субдифракицонной флуоресцентной микроскопией, основанной на последовательной регистрации изображений одиночных флуоресцентных молекул (локализационная микроскопия).


  4. Образовательный лабораторный курс «Основы молекулярной биологии» для студентов 3 курса кафедры «Биофизика»

    Участие в курсе позволяет каждому студенту овладеть современными методами молекулярного клонирования, генной инженерии и выделения белков под руководством аспирантов и молодых ученых лаборатории с использованием реагентов и современного оборудования, приобретенного на средства мегагранта. В течение года обучается 20 студентов третьего курса.

    (подробнее о курсе)

  5. Участие студентов и аспирантов в текущих проектах центра в рамках подготовки ими дипломных работ и диссертаций

  6. НИК «НаноБио» приглашает студентов и аспирантов для участия в текущих проектах центра и подготовки дипломных работ и диссертаций на основе результатов исследований.

    Текущие студенческие проекты
    1. Сергей Смирнов, 6 курс ИТМО
    2. Мария Орехова, 5 курс ИФНиТ СПбПУ
    3. Александр Кириллов, 5 курс ИФНиТ СПбПУ
    4. Арина Дробышева, 4 курс, ИФНиТ СПбПУ
    5. Елена Знобищева, 4 курс ИФНиТ СПбПУ
    6. Анна Литвинова, 4 курс ИФНиТ СПбПУ
    7. Полина Павлинова, 4 курс ИФНиТ СПбПУ
    8. Степан Праздничных, 4 курс ИФНиТ СПбПУ
    9. Дарья Резинюк, 4 курс ИФНиТ СПбПУ
    10. Анастасия Чабан, 4 курс ИФНиТ СПбПУ
    11. Марина Абрамова, 3 курс ИФНиТ СПбПУ
    12. Максим Казалов, 3 курс ИФНиТ СПбПУ
    13. Вероника Лесневская, 3 курс ИФНиТ СПбПУ
    14. Ольга Сидоренкова, 3 курс БиоФак СПбУ
    15. Ирина Французова, 1 курс БиоФак СПбУ

    Текущие аспирантские проекты
    1. Анатолий Арсениев, аспирант 4 года НИК «НаноБио», тема кандидатской диссертации «…»
    2. Научный руководитель: Константин Викторович Северинов
    3. Алексей Ведяйкин, аспирант 4 года НИК «НаноБио», тема кандидатской диссертации «...»
    4. Научный руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
    5. Наталия Морозова, аспирант 4 года НИК «НаноБио», тема кандидатской диссертации «...»
    6. Научный руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
    7. Елена Максимова, аспирант 4 года НИК «НаноБио», тема кандидатской диссертации «...»
    8. Научный руководитель: Андрей Леонидович Коневега
    9. Александр Алексеев, аспирант 2 года НИК «НаноБио», тема кандидатской диссертации «...»
    10. Научный руководитель: Михаил Алексеевич Ходорковский
    11. Нина Колчина, аспирант 2 года НИК «НаноБио», тема кандидатской диссертации «...»
    12. Научный руководитель: Михаил Геннадьевич Петухов

    Подготовленные дипломные работы и диссертации:

    • Бакалаврские проекты
      1. Андрей Андреев, бакалавровский проект «Локализационная микроскопия с использованием красителей YOYO-1 и Atto647», июнь 2011
      2. Анна Фефилова, бакалаврский проект «Оптическая ловушка для исследования биологических объектов», июнь 2012
      3. Алексей Ведяйкин, бакалаврский проект «Разработка методики молекулярного комбинга для микроскопии ДНК субдифракционного разрешения», июнь 2012
      4. В настоящее время аспирант центра.
      5. Александр Алексеев, бакалаврский проект «Исследование взаимодействия ДНК с интеркалирующим красителем GelRed на одномолекулярном уровне», июнь 2014
      6. В настоящее время аспирант центра.
      7. Алия Макулова, бакалаврский проект «Исследование взаимодействия интеркалирующего красителя Иодид Пропидия с двунитевой ДНК на одномолекулярном уровне», июнь 2014
      8. Владимир Горбунов, бакалаврский проект «Тестирование алгоритма стабилизации объекта для локализационной микроскопии», июнь 2014
      9. Наталия Константинова, бакалаврский проект «Изучение стохастичности экспрессии генов системы рестрикции модификации Esp 1396I», июнь 2014
      10. Влада Харченко, бакалаврский проект «Создание векторов и сверхэкспрессия белков NUDT12 и NUDT13 в клетках человека и бактериальных клеток», июнь 2015
      11. Дмитрий Анофриев, бакалаврский проект «Исследование сечения двухфотонного поглощения для органических красителей из класса кумаринов», июнь 2015
      12. Софья Панафидина, бакалаврский проект «Исследование ДНК-белковых взаимодействий при помощи измерения анизотропии флуоресценции», июнь 2015
      13. Василиса Полиновская, бакалаврский проект «Подбор оптимальных условий для осуществления локализационной микроскопии в E. coli», июнь 2015
      14. Алевтина Корешова, бакалаврский проект «Изучение невирионной РНК-полимеразы, кодируемой бактериофагом phiKZ», июнь 2017
      15. Александр Кириллов, бакалаврский проект «Исследование системы рестрикции-модификаци II типа ESP1396I  в клетках Escherichia Coli», июнь 2017
      16. Мария Орехова, бакалаврский проект «Конструирование и характеризация ДНК-субстратов для проведения исследований на уровне одиночных молекул», июнь 2017
      17. Елена Пономарева, бакалаврский проект «», июнь 2017
      18. Виталий Стуканёв, бакалаврский проект «», июнь 2017

    • Магистерские диссертации
      1. Антон Сабанцев, магистерская диссертация «Локализационная микроскопия ДНК, окрашенной YOYO-1», июнь 2011
      2. Павел Афанасьев, магистерская диссертация «Методики исследования ДНК-связывающих белков одномолекулярными методами», июнь 2011
      3. Мария Соколова, магистерская диссертация «АТФ-азная активность белка TIP49a», июнь 2013
      4. В настоящее время сотрудник центра.
      5. Яна Фёдорова, магистерская диссертация «Олигомеризация белков Tip49A/B и их связывание с ДНК», июнь 2013
      6. В настоящее время сотрудник центра.
      7. Вероника Куликова, магистерская диссертация «Разработка метода иммуно-аффинной очистки протеасом из клеток человека», июнь 2013
      8. В настоящее время сотрудник центра.
      9. Дарья Воронцова, магистерская диссертация «Предполагаемые РНК-полимеразы, кодируемые бактериофагом φKZ», июнь 2013
      10. Алексей Ведяйкин, магистерская диссертация «Локализационная микроскопия как метод для изучения организации бактериального цитоскелета», июнь 2014
      11. В настоящее время аспирант центра.
      12. Наталия Морозова, магистерская диссертация «Механические свойства клеточных мембран гепатоцитов», июнь 2014
      13. В настоящее время аспирант центра.
      14. Александр Алексеев, магистерская диссертация «», июнь 2016
      15. В настоящее время аспирант центра.
      16. Эрик Живкопляс, магистерская диссертация «», июнь 2017
      17. Марина Слащева, магистерская диссертация «», июнь 2017
      18. Василиса Полиновская, магистерская диссертация «Микроскопия сверхвысокого разрешения для изучения роли белка FtsZ микоплазм», июнь 2017
      19. Софья Панафидина, магистерская диссертация «Изучение взаимодействия CRISPR-Cas9 комплекса с ДНК методом молекулярных маяков (molecular beacons)», июнь 2017
      20. Ольга Толичева, магистерская диссертация «», июнь 2017
      21. Дарья Трескова, магистерская диссертация «Кинетические исследования связывания тРНК с А сайтом рибосомы», июнь 2017

    • Кандидатские диссертации
      1. Антон Сабанцев, кандидатская диссертация «Молекулярные механизмы действия белков FtsZ, виллина и системы рестрикции-модификации Esp1396I, исследованные флуоресцентными методами», декабрь 2014
      2. Егор Побегалов, кандидатская диссертация «Особенности взаимодействия ДНК с белками и интеркалирующими красителями, выявленные на одномолекулярном уровне методом оптического захвата», апрель 2016
      3. В настоящее время сотрудник центра.
      4. Арина Афанасьева, кандидатская диссертация «Молекулярное моделирование динамики и механизмов действия АТФаз семейства TIP49», декабрь 2015
      5. Мария Якунина, кандидатская диссертация «Функциональная активность и биохимические свойства невирионной многосубъединичной РНК-полимеразы бактериофага phiKZ», декабрь 2016
      6. В настоящее время сотрудник центра.
      7. Вероника Куликова, кандидатская диссертация «Механизмы образования и взаимодействия внутри- и внеклекточных пулов рибозидов никотинамида и никотиновой кислоты в клетках человека», декабрь 2017
      8. В настоящее время сотрудник центра.