Направления исследований

Структурно–протеомное направление:
  • Разработка метода динамической субдифракционой флуоресцентной микроскопии клеточных структур (локализационная микроскопия) (подробнее о методе);
  • Исследование структур, формируемых белком FtsZ, в клетках Mycoplasma hominis методом локализационной микроскопии;
  • Исследования механических свойств клеточных мембран методом оптической ловушки;
  • Одномолекулярные исследования ДНК и ДНК-белковых взаимодействий в оптической ловушке;
  • Биофизика и биохимия белков TIP49 на уровне индивидуальных молекул:
    • Разработка методики определения сайтов связывания белков TIP49 с ДНК с помощью ЯМР и масс- спектрометрии;
    • Исследование свойств ДНК-субстрата при связывании с белками TIP49 методом оптической ловушки с использованием УСУ «Лазерный пинцет»;
    • АТФ-азная активность белков TIP49;
    • Связывание с ДНК белков Tip49a и Tip49b и их олигомерные состояния;
    • Исследования олигомерных состояний белка Tip49a методами малоуглового нейтронного и рентгеновского рассеяния;
  • Комплексное исследование путей биосинтеза NAD в клетках человека;
  • Роль доменов и междоменных линкеров в регуляции филаментов актина белками семейства виллина.
Исследование механизмов и динамики нуклеотид-связывающих белков: от бактерий до человека:
  • Исследование механизмов и динамики взаимодействия белка RecA E. coli и D. radiodurans с ДНК, а также регуляции этого процесса вспомогательными белками RecX, SSB и DinI биохимическими, оптическими и одномолекулярными биофизическими методами;
  • Исследование динамики и механизмов регуляции структур, формируемых белком FtsZ в клетках бактерий при помощи генноинженерных методов и субдифракционной микроскопии;
  • Изучение взаимодействий между компонентами макромолекулярного рибонуклеопротеинового рибосомного комплекса в процессе трансляции с использованием биохимических и одномолекулярных биофизических методов;
  • Установление связи между структурой и функцией жизненно важных белков семейства TIP49 и исследовании молекулярных механизмов их действия.
    (подробнее о направлении)
Молекулярная, прикладная и экологическая микробиология:
  • Исследование регуляции транскрипции фагового генома в ходе инфекции клеток Pseudomonas aeruginosa бактериофагами типа phiKZ;
  • Исследования молекулярных механизмов транскрипции прокариот и способов ее регуляции;
  • Изучение на уровне одной клетке стохастических процессов, связанных с работой различных систем защиты бактерий от чужеродных нуклеиновых кислот;
  • Характеристика новых биологически активных компонентов (антибиотиков и микроцинов) из некультивируемых бактерий, природных образцов и метагеномов.
Биоаналитика, терапевтический мониторинг фармпрепаратов:
  • Разработка стандартных операционных процедур (СОП) пробоподготовки биологических объектов и фармакологических субстанций с использованием жидкостно-жидкостной и твердофазной экстракции;
  • Разработка методики определения винбластина в плазме крови методом высокоэффективной жидкостной хроматографии с масс-спектрометрическим детектированием;
  • Разработка и аттестация четырех методик хромато-масс-спектрометрического определения плазме крови в соответствии с текущими критериями и рекомендациями FDA и TPD (точность, воспроизводимость, достоверность, чувствительность, устойчивость, линейность, LLOQ) следующих фармпрепаратов: валсартан, амлодипин,мелфалан и цисплатин.
Молекулярная спектроскопия:
  • Исследования электронной структуры возбуждённых состояний димеров и кластеров инертных газов методами времяпролётной многофотонной резонансной лазерной ионизации (REMPI-TOF) и времяпролётной фотоэлектронной спектроскопии (REMPI-PES) (подробнее о направлении)