Новости

В декабре в НИК «Нанобиотехнологии» прошли два научных семинара

Отправлено 30 янв. 2018 г., 04:25 пользователем Лидия Ракчеева   [ обновлено 30 янв. 2018 г., 04:40 ]

20 и 27 декабря 2017 года в Научно-исследовательском комлпексе «Нанобиотехнологии» были проведены два международных научных семинара «Проблемы и перспективы использования оптогенетики» и «На пути к разработке новых препаратов на основе структурной информации, полученной с помощью криоэлектронной микроскопии».

Проблемы и перспективы использования оптогенетики
Немногим более десятилетия назад оптогенетика открыла новую эру в методических возможностях биологии. Сегодня мощный арсенал разнообразных оптогенетических и оптофармакологических методов и подходов позволяет осуществлять разносторонний и селективный мониторинг и контроль клеточной активности. На семинаре директор Института эволюционной физиологии и биохимии им. И.М. Сеченова Российской академии наук (ИЭФБ РАН) Фирсов М.Л. рассказал о возможностях использования в биохимических исследованиях новых инструментов оптогенетики, адресной доставки светочувствительных белков и низкомолекулярных фотопереключателей в клетки-мишени, токсичности и стабильности оптогенетических инструментов, интерпретации результатов и других методических возможностей. Обсуждение доклада выявило возможность использования некоторых из этих методов в текущих исследованиях лаборатории К.В.Северинова. 

На пути к разработке новых препаратов на основе структурной информации, полученной с помощью криоэлектронной микроскопии
Метод криоэлектронной микроскопии все большее широко используется для решения задач в области структурной биологии. Простота приготовления образцов в их родной среде, скорость сбора данных и развитость программного обеспечения для обработки полученных изображений, позволяет достаточно успешно конкурировать этому методу с рентгеновской кристаллографией, где приготовление образца как правило, представляет собой очень сложную и трудоемкую задачу. На семинаре сотрудник Лаборатории молекулярной биологии Совета по медицинским исследованиям (Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology, Кэмбридж, Великобритания) Павел Афанасьев рассказал о современных возможностях криоэлектронной микроскопии в решении структур белковых комплексов с разрешением порядка 3-3.5 ангстрем. Сотрудниками лаборатории К.В.Северинова было задано много вопросов докладчику как по основным приемам, используемым в этом методе, так и по возможности применения этого метода к тем объектам, которые исследуются в лаборатории. Особенно активно обсуждался получения данных о структуре фаговых РНКполимераз, молекулярный вес которых не более 350-400 кДа. В процессе обсуждения выяснилось, что эти задачи могут быть решены методом криоэлектронной микроскопии, и был намечен план возможной коллаборации с докладчиком. 

Кроме сотрудников Лаборатории молекулярной микробиологии и НИК «Нанобиотехнологии» в семинарах приняли участие аспиранты и научные сотрудники с кафедры «Биофизика» СПбПУ, а также из Петербургского института ядерной физики (ПИЯФ), Института Цитологии РАН и НИИ Гриппа.

Лекция «Революция в криоэлектронной микроскопии; красота нанобиологии и её польза для развития наук о жизни» доктора Питера Питерса, 24 мая в 16-00

Отправлено 18 мая 2016 г., 05:00 пользователем Лидия Ракчеева   [ обновлено 18 мая 2016 г., 07:21 ]

24 мая в 16-00 в Научно-исследовательском комплексе «Нанобиотехнологии» СПбПУ с лекцией «Революция в криоэлектронной микроскопии; красота нанобиологии и её польза для развития наук о жизни» («A revolution in Cryo-EM; beauty and benefits of nano biology in life science») выступит Питер Питерс, профессор Института мультимодальной визуализации Университета Маастрихта (Голландия).
Семинар пройдёт на английском языке.

Доктор Питерс Питерс расскажет о криоэлектронной микроскопии и криоэлектронной томографии. При помощи продвинутых алгоритмов на основе изображений белковых комплексов, полученных при помощи криоэлектронной микроскопии, можно реконструировать трехмерные структуры этих комплексов с разрешением выше 3 ангстрем, благодаря чему этот метод был назван журналом Natutre методом года в 2015 году. На наших глазах благодаря криоэлектронной микроскопии происходит революция в структурной биологии.

Также доктор Питерс расскажет про коррелированную световую и электронную микроскопию с травлением образца при помощи фокусируемого ионного пучка. Этот метод позволяет выбрать интересующую область образца при помощи световой микроскопии и затем получить при помощи криоэлектронной микроскопии изображение этой области с высоким (2 нм и выше) разрешением. Впоследствии докинг известных трехмерных структур белковых комплексов на полученном изображении позволяет определить расположение этих комплексов в изучаемой структуре. 

Адрес: НИК «Нанобиотехнологии», Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, ул. Политехническая, д. 29, Гидрокорпус-2, ауд. 108.
Телефон для связи: 5529809

Обновление раздела «Семинары, конференции»

Отправлено 23 окт. 2015 г., 06:09 пользователем Лидия Ракчеева

Появился список прошедших в 2015 конференций, на которых были представлены работы центра. Подробнее смотрите в разделе «Семинары, конференции».

Simple PRO - завод лабораторной мебели

Отправлено 12 окт. 2015 г., 05:09 пользователем Лидия Ракчеева

Завод лабораторной мебели Simple PRO выпустил рекламный ролик, при съёмках которого задействованы помещения Лаборатории молекулярной микробиологии для проведения молекулярно-микробиологических и биохимических исследований (см. в самом начале и на отметке 2:57).


Образовательный лабораторный курс «Основы молекулярной биологии»

Отправлено 28 сент. 2015 г., 07:24 пользователем Лидия Ракчеева   [ обновлено 4 февр. 2016 г., 05:30 ]

С этого года года аспиранты и молодые ученые Лаборатории молекулярной микробиологии ведут курс практических занятий для студентов третьего курса кафедры «Биофизика». Программа практикума была разработана Соколовой М.Л., Фёдоровой Я.В., Майковой А.С. и Якуниной М.В. совместно с руководителем лаборатории Севериновым К.В. с использованием материалов программы профессиональной переподготовки в области бионанотехнологии, бионаномедицины и бионанофармакологии, разработанной Институтом биологии гена РАН при поддержке Фонда инфраструктурных и образовательных программ РОСНАНО. Практикум включен в учебный план кафедры «Биофизики» как часть лабораторного курса.

Все студенты за время практикума смогут сами заклонировать и потом выделить свой первый рекомбинантный белок. Очень важно, что каждый во время практикума может вдоволь поработать руками, смешать свою собственную реакцию, нанести пробы на электрофорезный гель, ну и конечно наделать своих собственных первых ошибок и разобрать их с помощью преподавателей.

Методы, которые освоят студенты в процессе работы, лежат в основе деятельности практически любой лаборатории занимающейся молекулярной биологией, так что полученные навыки послужат ребятам прочным фундаментом их будущей карьеры в данной области.

Преподаватели: Мария Соколова, Яна Фёдорова, Анна Майкова.  

  
 
  
   

Журнальный клуб, 26 августа

Отправлено 25 авг. 2015 г., 05:45 пользователем Лидия Ракчеева   [ обновлено 26 авг. 2015 г., 05:28 ]

26 августа в 17:00 в нашем центре пройдёт Журнальный клуб.

Антон Сабанцев представит статью Jintao Liu et al., Metabolic co-dependence gives rise to collective oscillations within biofilms, Nature 523, 550–554, doi:10.1038/nature14660

Адрес: НИК «Нанобиотехнологии», Гидрокорпус-2, ауд. 108, семинарская на 2 этаже

Международный практический семинар по новым методам характеризации белковых структур, 10 и 11 июня

Отправлено 9 июн. 2015 г., 05:32 пользователем Лидия Ракчеева

10 и 11 июня в Научно-исследовательском комплексе «Нанобиотехнологии» пройдёт Международный практический семинар по новым методам характеризации белковых структур.

В программе семинара выступления приглашённых докладчиков (Piotr Wardega, Dr.Marek Zurawski, сотрудники компании NanoTemper Technologies) и сотрудников центра (Андрей Коневега) по методам характеризации белковых структур термодиффузионными методами, в том числе методом микромасштабной термодиффузии, Технологии nanoDSF, Технология SAW (Surface Acoustic Wave). 

Также предусмотрена экспериментальная работа с образцами исследователей и демонстрационными образцами.

Время проведения семинара:
10 июня, 9:00 – 19:00
11 июня, 9:00 – 16:00

Место проведения семинара: Научно-исследовательский комплекс «Нанобиотехнологии», Гидрокорпус-2, ауд. 108, второй этаж, семинарская комната.

Желающие принять участие: слушатели – практически без ограничений.
Желающие попробовать свои образцы: обращайтесь к Дарье Виноградовой

Предзащита бакалавровских проектов, 8 июня

Отправлено 8 июн. 2015 г., 03:44 пользователем Лидия Ракчеева

8 июня в 16:00 пройдёт предзащита бакалавровских проектов:
  • Дмитрий Анофриев, «Исследование сечения двухфотонного поглощения для органических красителей из класса кумаринов»
  • Влада Харченко, «Создание векторов и сверхэкспрессия белков NUDT12 и NUDT13 в клетках человека и бактериальных клеток»
Место проведения семинара: НИК «Нанобиотехнологии», Гидрокорпус-2, ауд. 108, 2 этаж, семинарская аудитория

Журнальный клуб, 24 марта

Отправлено 23 мар. 2015 г., 08:59 пользователем Лидия Ракчеева

24 марта в 14:00 пройдёт Журнальный клуб.

Антон Сабанцев представит статью об изучении комплементарного узнавания целей малыми регуляторными РНК при помощи субдифракционной микроскопии:
  • Jingyi Fei et al. «Determination of in vivo target search kinetics of regulatory noncoding RNA»
    Science 347, 1371 (2015); DOI: 10.1126/science.1258849
Адрес: НИК «Нанобиотехнологии», Гидрокорпус-2, ауд. 108, 2 этаж

1-10 of 51