Оборудование

НИК «НаноБио» располагает следующим оборудованием:
  1. ЯМР спектрометр Varian DirectDrive NMR System 700 Mhz
    • Инверсный солеустойчивый датчик тройного резонанса 1H/13C/15N
    • Инверсный широкополосный датчик тройного резонанса 1H/{15N-31P}/13C
    • Широкополосный датчик прямого наблюдения {15N-31P}/1H
    • Все датчики оборудованы Z-градиентной катушкой, lock-каналом и предназначены для использования с 5мм ампулами.

  2. Масс-спектрометр с ионно-циклотронным резонансом с Фурье преобразованием FTMS и двумя ионными источниками ионизации: электроспрей и МАЛДИ (FT-ICR MS 9.4 Tesla,Varian, США)
  3. Масс-спектрометр со сверхвысоким разрешением для определения состава и структуры высокомолекулярных соединений (диапазон масс 500 – 4500 m/z)

    • 902-MS МАЛДИ:
      • с точностью определения масс < 2 ppm для m/z 1046 (Angiotensin II)
      • с разрешением 250000 для m/z 1046 (Angiotensin II)
      • c чувствительностью 50:1 (отношение сигнала к шуму) для m/z 1046 100 fmol Angiotensin II
    • 910-MS электроспрей
      • с точностью определения масс < 1.5 ppm для m/z 403.2 (Cortisone -21 Acetate)
      • с разрешением 490000 для m/z 403.2 (Cortisone -21 Acetate)
      • чувствительностью 50:1 для m/z 609 для 5 fmol Reserpine

    Режимы диссоциации ионов CID, ECD и IRMD.

  4. Масс спектрометр AB Sciex 5800 MALDI TOF-TOF
  5. Время-пролетный масс-спектрометр c тремя режимами работы:

    • мода рефлектрона (диапазон масс 800 – 4000 m/z)
      • точность определения масс 30 ppm для m/z 2093 (ACTH (clip 1-17))
      • разрешение > 24000 для m/z 2093
      • разрешение > 15000 для m/z 1296 и m/z 3657
      • чувствительность > 500 для m/z 2093 для 100 fmol (ACTH (clip 1-17))
      • чувствительность > 100 для m/z 1672 для 250 amol (Neurotensin)
    • мода ms/ms (диапазон масс до 4000 m/z) для фрагментов Glu-Fibrinopeptide B
      • точность определения масс ~ 0.05 -0.1 Da
      • разрешение > 3000
      • чувствительность > 500 для 75 fmol (Glu-Fibrinopeptide B)
      • чувствительность > 30 для 1.5 fmol (Angiotensin I)
    • линейная мода
      • малые массы (диапазон масс 800 – 4000 m/z)
        • точность определения масс 500 ррм
        • разрешение > 3000
        • чувствительность > 200 для 5 fmol
      • диапазон средних масс 4000 – 20000 m/z
        • точность 0,05%
        • разрешение > 500
        • чувствительность > 200 для 3 fmol
        • диапазон больших масс 20000 – 140000 m/z
        • чувствительность > 80 для 3 fmol 66430 m/z (BSA)

  6. Хромато-масс-спектрометр LCMS–IT–TOF (Shimadzu, Япония)
  7. n анализ до МС10

    • Разрешение 8000 -10000 в зависимости от диапазона масс
    • Погрешность измерения массы не более 5 ppm во всех режимах работы: МС, МС/МС и МС/МС/МС
    • Чувствительность по резерпину в МС2 режиме 5 пикограмм при соотношении сигнал/шум 50:1
    • Время регистрации спектра <100 миллисекунд

  8. Комплекс исследования динамики нанобиомашин FA-1
  9. FA1 - установка на базе исследовательского микроскопа Carl Zeiss Axio Imager Z1. FA1 позволяет осуществлять уникальные одномолекулярные биофизические эксперименты методом оптического захвата (или лазерного пинцета, англ. optical trapping или optical tweezers). Лазерный пинцет широко используется для исследования взаимодействий между одиночными биологическими молекулами, например, взаимодействий между ДНК и белками (изучение процессов транскрипции, трансляции, репликации, репарации), а также динамики межбелковых взаимодействий (в частности, исследование моторных белков). Данный метод позволяет при этом прецизионно измерять силы взаимодействия между исследуемыми молекулами на уровне, характерном для внутриклеточных процессов. Кроме того, оптический захват позволяет проводить манипуляции с живыми клетками, например, изучать механические свойства клетки и её составных частей. Кроме метода оптического захвата, на установке FA1 реализованы методы флуоресцентной микроскопии, в том числе микроскопии сверхвысокого разрешения (англ. super-resolution microscopy, PALM, STORM).

    На базе комплекса создана уникальная комплексная установка для исследования динамики нанобиомашин (УНУ «Лазерный Пинцет»)

  10. Комплекс оборудования для одномолекулярных исследований на базе спектрометра с поверхностно-акустической волной (акустический нанопинцет)
  11. Комплекс обеспечивает манипулирование и измерение в режиме реального времени прецизионного положения биомолекул при воздействии на них акустических волн с силами от долей до сотен пиконьютон с субмиллисекундным разрешением. При измерении положения биомолекул реализуются следующие параметры: при одновременном измерении 400 молекул в пространстве 3D точность определения положенияне хуже 3 нанометров; при одновременном измерении 2000 молекул в пространстве 2D точность не хуже 2 нанометров; минимальное приращение силы воздействия на одну молекулу не более 2 фемтоньютон; максимальная сила воздействия на одну молекулу не менее 100 пиконьютон; скорость изменения прикладываемой силы к молекулам не меньше диапазона 10-4 - 103 пиконьютон в секунду.

    Комплекс входит в состав уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин (УНУ «Лазерный Пинцет»)

  12. Фемтосекундная лазерная система RAPOP-100 (АВЕСТА, Россия)
  13. Фемтосекундная система RAPOP-100 состоит из лазера (Ti:Sa) и регенеративного усилителя.

    • Параметры лазера
      • Длина волны генерации 800нм
      • Частота повторения импульсов 80МГц
      • Длительность импульса 50фс
      • Выходная мощность 400мВт
    • Параметры регенеративного усилителя
      • Длина волны 800нм
      • Частота повторения импульсов 3 кГц
      • Длительность импульса 50фс
      • Энергия импульса 100 мкДж

    Лазерная система входит в состав уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин (УНУ «Лазерный Пинцет»)

  14. Микроскоп медико-биологический Nikon Ti с цифровой камерой
  15. Микроскоп позволяет решать широкий спектр задач, связанных с визуализацией биологических структур: флуоресцентная микроскопия (в том числе сверхвысокого разрешения - super-resolution microscopy), долговременная визуализация живых клеток в автоматическом режиме (time-lapse microscopy), а также рутинная визуализация.

    • Высокочувствительная sCMOS камера с размером матрицы 4,2 мегапикселя
    • Система инкубации (поддержание температерного режима)
    • Система поддержания постоянного фокуса Nikon Perfect Focus System (PFS)
    • 5 каналов флуоресценции (DAPI, CFP, YFP, RFP, Texas red)
    • Широкий спектр воздушных и иммерсионных объективов
    • Возможность использования чашек Петри и многолуночных планшетов

    Микроскоп входит в состав уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин (УНУ «Лазерный Пинцет»)

  16. Планшетный спектрофотометр CLARIOstar BMG LABTECH GmbH с функциями считывания сигнала с нижней стороны планшета и сверхбыстрой регистрации спектров поглощения в видимой и УФ-областях спектра, с возможностями: измерять поляризацию флуоресценции для длин волн более 350 нм, двумя инжекторами реагентов, инкубации образцов при температурах до 65ºC, измерение люминесценции в планшетах, содержащих до 384 лунок, измерение флуоресценции в режиме разрешения по времени.

  17. Комплект оборудования пробоподготовки
    • Комплекс оптико-электронных приборов для физико-химического анализа биологических образцов:
      • Спектрофулориметр Cary Eclipse (с комплектом BioMelt);
      • Сканирующий спектрофотометр Cary 50;
      • Спектрофотометр Cary 5000 (175 - 3300 нм);
      • КД-спектрометр Jasco J-815.

    • Высокопроизводительная центрифуга для разделения биологических образцов Avanti J-30i Beckman Coulter (с набором роторов JS-24.15, JS-24.38, JA-18, JA-18.1, JA-21, JA-30.50);
    • Оборудование для термостатирования и создания вакуумных условий для подготовки и исследования биологических образцов:
      • Термостат жидкостной циркуляционный С10-ВЗ Thermo (Haake);
      • Водяная баня Elmi ТW-2.02;
      • Hacoc вакуумный мембранный Millipor;
      • Насос вакуумно-нагнетательный высокоэффективный Millipor.
    • Оборудование для подготовки клеточных культур и животных тканей с целью выделения из них белковых фракций:
      • Автоклав Tuttnauer 3850 M;
      • Шейкер-инкубатор BBI CERTOMAT ВS-1;
      • Гомогенизатор Potter S;
      • Ультразвуковой гомогенизатор LABSONIC-P;
      • Аппарат-концентратор на полых волокнах УПЛ НПК «Биотест»;
      • Лиофильная сушка FreZone 2,5 L Labconco (США).
    • Комплекс электромеханических приборов для разделения неоднородной смеси на составные части различной плотности биологических образцов:
      • Центрифуга большого объема с охлаждением Hermle Z 513 K;
      • Микроцентрифуга с охлаждением Centurion Scientific K2080R;
      • Центробежный ДНК концентратор CentriVap Labconco (США).
    • Оборудование для водоподготовки методами дистилляции и мембранной фильтрации:
      • Дистиллятор GFL2004;
      • Бидистиллятор GFL2104;
      • Настольная установка для производства высокоочищенной воды Millipor Milli Q Synthesis со сменными картриджами.

    Комплекс входит в состав уникальной комплексной установки для исследования динамики нанобиомашин (УНУ «Лазерный Пинцет»)

  18. Оборудованные лаборатории для биохимических и молекулярно-биологических исследований
    • Хроматография
      • Хроматограф Akta Purifier 10 (GE Healthcare)
      • Хроматограф LC 20 Prominence XR (Shimadzu)

    • Комплекс оборудования для работ по экспрессии белков
      • Шейкер-инкубатор для роста термофильных бактерий Thermotron (Inforс)
      • Шейкер-инкубатор для роста мезофилов с блоком охлаждение и с блоком для роста фототрофов Multitron Pro (Inforc)
      • Термостат суховоздушный BD 53 (Binder) 3 штуки
      • Автоклав 5050 ELV (Tuttnauer) большого объема
      • Анаэробный бокс Bactron 300-2 (Sheldon Manufacturing), имеет внутри инкубатор на 37 градусов, газовая смесь: 5% H2, 5% CO2, 90% N2

    • Организация проведения экспериментов с впомощью метода ПЦР в реальном времени
      • Амплификатор для ПЦР в реальном времени CFX96 TouchRealTime System (Bio-Rad)
      • ПЦР-бокс UVC/T-M-AR (BioSan) для подготовки образцов

    • Центрифугирование
      • Центрифуги многофункциональные 5804 R (Eppendorf) с роторами F-34-6-38, A-2-DWP
      • Высокопроизводительная центрифуга для разделения биологических образцов Avanti J-30i Beckman Coulter с роторами JS-24.15, JS-24.38, JA-18, JA-18.1, JA-21, JA-30.50, JLA-10.500
      • Центрифуга напольная с охлаждением Sorvall™ RC 12BP Plus Large Capacity Centrifuge с бакет-ротор H-12000 Bioprocessing (6 стаканов по 2000 мл, V max= 4 700 об/мин (7 340 g))

    • Мультифункциональной гельдокументирующая система ChemiDoc MP (Bio-Rad)

    Также присутствует набор базового оборудования для молекулярно-биологических и биохимических работ.